• Türkçe
    • English
  • Türkçe 
    • Türkçe
    • English
  • Giriş
Öğe Göster 
  •   Açık Erişim Ana Sayfası
  • Avesis
  • Dokümanı Olmayanlar
  • Makale
  • Öğe Göster
  •   Açık Erişim Ana Sayfası
  • Avesis
  • Dokümanı Olmayanlar
  • Makale
  • Öğe Göster
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

Molecular signatures of chronic periodontitis in gingiva: A genomic and proteomic analysis

Tarih
2019
Yazar
Gumuslu, Esen
Olgac, Vakur
BALTA, VECİHE MERVE
GÜZELDEMİR AKÇAKANAT, ESRA
SAVLI, HAKAN
Alkan, Begum
SÜNNETÇİ AKKOYUNLU, DENİZ
Gurel, Busra
Kan, Bahadir
Akgun, Emel
Yilmaz, Elif Busra
BAYKAL, Ahmet Tarık
ÇİNE, NACİ
Üst veri
Tüm öğe kaydını göster
Özet
Background To elucidate molecular signatures of chronic periodontitis (CP) using gingival tissue samples through omics-based whole-genome transcriptomic and whole protein profiling. Methods Gingival tissues from 18 CP and 25 controls were analyzed using gene expression microarrays to identify gene expression patterns and the proteins isolated from these samples were subjected to comparative proteomic analysis by liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS). The data from transcriptomics and proteomics were integrated to reveal common shared genes and proteins. Results The most upregulated genes in CP compared with controls were found as MZB1, BMS1P20, IGLL1/IGLL5, TNFRSF17, ALDH1A1, KIAA0125, MMP7, PRL, MGC16025, ADAM11, and the most upregulated proteins in CP compared with controls were BPI, ITGAM, CAP37, PCM1, MMP-9, MZB1, UGTT1, PLG, RAB1B, HSP90B1. Functions of the identified genes were involved cell death/survival, DNA replication, recombination/repair, gene expression, organismal development, cell-to-cell signaling/interaction, cellular development, cellular growth/proliferation, cellular assembly/organization, cellular function/maintenance, cellular movement, B-cell development, and identified proteins were involved in protein folding, response to stress, single-organism catabolic process, regulation of peptidase activity, and negative regulation of cell death. The integration and validation analysis of the transcriptomics and proteomics data revealed two common shared genes and proteins, MZB1 and ECH1. Conclusion Integrative data from transcriptomics and proteomics revealed MZB1 as a potent candidate for chronic periodontitis.
Bağlantı
http://hdl.handle.net/20.500.12627/133818
https://doi.org/10.1002/jper.18-0477
Koleksiyonlar
  • Makale [92796]

Creative Commons Lisansı

İstanbul Üniversitesi Akademik Arşiv Sistemi (ilgili içerikte aksi belirtilmediği sürece) Creative Commons Alıntı-GayriTicari-Türetilemez 4.0 Uluslararası Lisansı ile lisanslanmıştır.

DSpace software copyright © 2002-2016  DuraSpace
İletişim | Geri Bildirim
Theme by 
Atmire NV
 

 


Hakkımızda
Açık Erişim PolitikasıVeri Giriş Rehberleriİletişim
sherpa/romeo
Dergi Adı/ISSN || Yayıncı

Exact phrase only All keywords Any

BaşlıkbaşlayaniçerenISSN

Göz at

Tüm DSpaceBölümler & KoleksiyonlarTarihe GöreYazara GöreBaşlığa GöreKonuya GöreTürlere GöreBu KoleksiyonTarihe GöreYazara GöreBaşlığa GöreKonuya GöreTürlere Göre

Hesabım

GirişKayıt

Creative Commons Lisansı

İstanbul Üniversitesi Akademik Arşiv Sistemi (ilgili içerikte aksi belirtilmediği sürece) Creative Commons Alıntı-GayriTicari-Türetilemez 4.0 Uluslararası Lisansı ile lisanslanmıştır.

DSpace software copyright © 2002-2016  DuraSpace
İletişim | Geri Bildirim
Theme by 
Atmire NV