• Türkçe
    • English
  • Türkçe 
    • Türkçe
    • English
  • Giriş
Öğe Göster 
  •   Açık Erişim Ana Sayfası
  • Avesis
  • Dokümanı Olmayanlar
  • Makale
  • Öğe Göster
  •   Açık Erişim Ana Sayfası
  • Avesis
  • Dokümanı Olmayanlar
  • Makale
  • Öğe Göster
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

Analysis of ACE2 and TMPRSS2 coding variants as a risk factor for SARS-CoV-2 from 946 whole-exome sequencing data in the Turkish population

Tarih
2022
Yazar
DUMAN, NİLGÜN
Uyanik, Bulent
Erdogan, Murat
Balta, Burhan
Kiraz, Aslihan
Sag, Sebnem Ozemri
TUĞ BOZDOĞAN, SEVCAN
BİŞGİN, ATIL
Tuncel, Gulten
GÜL, Şeref
Ates, Esra Arslan
Alavanda, Ceren
Ozdemir, Sevda Yesim
Sezer, Ozlem
Ozgon, Gulay Oner
Gurkan, Hakan
Guler, Kubra
Boga, Ibrahim
Kaya, Niyazi
Alemdar, Adem
Sayan, Murat
Dundar, Munis
Ergoren, Mahmut Cerkez
Temel, Sehime Gulsun
Geckinli, Bilgen Bilge
Ata, Pinar
Canbek, Sezin
Üst veri
Tüm öğe kaydını göster
Özet
Heterogeneity in symptoms associated with COVID-19 in infected patients remains unclear. ACE2 and TMPRSS2 gene variants are considered possible risk factors for COVID-19. In this study, a retrospective comparative genome analysis of the ACE2 and TMPRSS2 variants from 946 whole-exome sequencing data was conducted. Allele frequencies of all variants were calculated and filtered to remove variants with allele frequencies lower than 0.003 and to prioritize functional coding variants. The majority of detected variants were intronic, only two ACE2 and three TMPRSS2 nonsynonymous variants were detected in the analyzed cohort. The main ACE2 variants that putatively have a protective or susceptibility effect on SARS-CoV-2 have not yet been determined in the Turkish population. The Turkish genetic makeup likely lacks any ACE2 variant that increases susceptibility to SARS-CoV-2 infection. TMPRSS2 rs75603675 and rs12329760 variants that were previously defined as common variants that have different allele frequencies among populations and may have a role in SARS-CoV-2 attachment to host cells were determined in the population. Overall, these data will contribute to the formation of a national variation database and may also contribute to further studies of ACE2 and TMPRSS2 in the Turkish population and differences in SARS-CoV-2 infection among other populations.
Bağlantı
http://hdl.handle.net/20.500.12627/188280
https://doi.org/10.1002/jmv.27976
Koleksiyonlar
  • Makale [92796]

Creative Commons Lisansı

İstanbul Üniversitesi Akademik Arşiv Sistemi (ilgili içerikte aksi belirtilmediği sürece) Creative Commons Alıntı-GayriTicari-Türetilemez 4.0 Uluslararası Lisansı ile lisanslanmıştır.

DSpace software copyright © 2002-2016  DuraSpace
İletişim | Geri Bildirim
Theme by 
Atmire NV
 

 


Hakkımızda
Açık Erişim PolitikasıVeri Giriş Rehberleriİletişim
sherpa/romeo
Dergi Adı/ISSN || Yayıncı

Exact phrase only All keywords Any

BaşlıkbaşlayaniçerenISSN

Göz at

Tüm DSpaceBölümler & KoleksiyonlarTarihe GöreYazara GöreBaşlığa GöreKonuya GöreTürlere GöreBu KoleksiyonTarihe GöreYazara GöreBaşlığa GöreKonuya GöreTürlere Göre

Hesabım

GirişKayıt

Creative Commons Lisansı

İstanbul Üniversitesi Akademik Arşiv Sistemi (ilgili içerikte aksi belirtilmediği sürece) Creative Commons Alıntı-GayriTicari-Türetilemez 4.0 Uluslararası Lisansı ile lisanslanmıştır.

DSpace software copyright © 2002-2016  DuraSpace
İletişim | Geri Bildirim
Theme by 
Atmire NV