MMP9 Geninin Aort Diseksiyonundaki Olası Etkilerinin Araştırılması

Abstract

Amaç: Kardiyovasküler hastalıklar ve kanser metastazında sıklıkla araştırılan matriks metalloproteinazlar (MMPs) ekstraselüler matriks düzenleyicileridir. Çalışmamız, aort diseksiyonu olan hastalarda MMP9 genindeki spesifik polimorfizmleri incelemeyi ve MMP9'un aort diseksiyonu üzerindeki etkisini ekspresyon veri setleri ile karşılaştırmayı amaçlamaktadır. Gereç ve Yöntem: Q279R ve P574R polimorfizmleri 44 aort diseksiyon tanısı almış ve 40 sağlıklı bireyde polimeraz zincir reaksiyonu - restriksiyon parça uzunluğu polimorfizmi (PCR-RFLP) yöntemiyle çalışıldı. Q279R ve P574R prevalansı istatistiksel olarak hastaların tıbbi verileriyle karşılaştırıldı. Buna ek olarak, NCBI GEO veri tabanından aort diseksiyon veri setleri toplandı ve MMP9 ifadesindeki farklılıkları görmek amacıyla bu veri setleri GEO2R ve RStudio ile yeniden analiz edildi. Elde edilen sonuçların informatik analizi için çevrimiçi veri tabanları kullanıldı. Bulgular: CG alleli taşıyıcısı kadınların aort diseksiyonu geliştirme riski erkeklerden daha yüksek bulunmasına rağmen her iki çalışma grubunda da allellerin genotipik dağılımı benzer bulunmuştur. MMP9'un protein-protein etkileşim analizinin ve hastaların tıbbi verilerinin incelenmesinin sonucu olarak, P574R hipertansiyonu olan hastalarda önemli bir bulgu olarak değerlendirilmiştir. Array verisi analizinde ise MMP9 ifadesinde kritik bir değişim gözlemlenmemiş olup, birçok örnekte TIMP ifade seviyelerinde azalma tespit edilmiştir. Ayrıca MMP9’u hedefleyen miRNA ekspresyon seviyelerinin aort dokusu ve kanda düşük olduğu saptanmıştır. Sonuç: Q279R ve P574R, MMP9 protein yapısını doğrudan etkilemeyen iki polimorfizmdir. İncelenen polimorfizmler ve gerçekleştirilen meta-analizler, MMP9'un fenotipi doğrudan etkilemediği, ancak istatistiksel sonuçlarda görüldüğü gibi aort diseksiyonu gelişimi için zemin hazırladığını göstermektedir. Anahtar Kelimeler: Aort diseksiyon, MMP9, Q279R, P574R, gen ifade verisi